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核酸片段分選？更準(zhǔn)、更快的選擇

貝克曼庫(kù)爾特生命科學(xué) 2020-09-16 | 閱讀：2557

近年來(lái)，高通量測(cè)序技術(shù)已經(jīng)日漸成為基因組學(xué)研究項(xiàng)目的標(biāo)準(zhǔn)。從樣品制備到文庫(kù)制備及最終測(cè)序，大多步驟都要求精確高效化、易于自動(dòng)化操作，并且許多高通量測(cè)序應(yīng)用都要求核酸片段在特定范圍內(nèi)緊密分布，因此精準(zhǔn)快速的進(jìn)行片段選擇步驟更具挑戰(zhàn)性。

在進(jìn)行核酸片段分選的過(guò)程中，傳統(tǒng)的瓊脂糖凝膠回收法不適于安全、高通量的操作，使用普通磁珠無(wú)法準(zhǔn)確做到片段大小的選擇，而使用Agencourt SPRIselect的片段分選產(chǎn)品可以得到集中的核酸片段分布，并且可以完全自動(dòng)化，廣泛應(yīng)用于：

核酸片段回收

核酸片段篩選

NGS、Sanger測(cè)序

qPCR、ddPCR等

Fig 1 Agencourt SPRIselect片段篩選試劑盒進(jìn)行目標(biāo)片段回收。

Agencourt SPRIselect試劑盒可常溫保存，方便使用。支持高效純化回收核酸片段（Fig 1）；同時(shí)可根據(jù)SPRIselect磁珠與樣品的比例選擇性結(jié)合特定大小的核酸片段，工作流程易于調(diào)整且靈活，以快速達(dá)到去除小片段、大片段、或去大&去小的目的（Fig 2A）。SPRIselect磁珠優(yōu)先結(jié)合大片段核酸，隨著磁珠與樣本體積比例增加，磁珠結(jié)合更小片段的效率增加，結(jié)合更大片段的效率降低。由此，操作人員可以自由選擇需要篩選的片段范圍，以滿(mǎn)足不同核酸長(zhǎng)度范圍的應(yīng)用需求（Fig 2B）。

Fig 2 （A） Agencourt SPRIselect片段篩選試劑盒進(jìn)行去除小片段、去除大片段、及目標(biāo)片段選擇回收。

（B）M: 2100檢測(cè)Marker；Shear: 彌散的DNA片段；0.XX - 0.XX: 片段分選時(shí)去大、去小的磁珠樣本比例。

高通量、簡(jiǎn)便操作

基于Agencourt SPRIselect試劑盒的核酸回收和片段選擇方法，貝克曼的Biomek自動(dòng)化移液站可在1小時(shí)內(nèi)完成96個(gè)樣本的全自動(dòng)流程，提供包含成熟的自動(dòng)化方法、穩(wěn)定的試劑、開(kāi)放的耗材等在內(nèi)的核酸回收和片段選擇體系。

如果需要不同片段范圍的文庫(kù)，用戶(hù)可以選擇在多孔反應(yīng)板中應(yīng)用多種樣品比率。Biomek自動(dòng)化移液站的靈活八通道加樣器可用于轉(zhuǎn)移不同體積SPRIselect磁珠和樣本，而多通道加樣器可用于快速批量去除上清液、乙醇并轉(zhuǎn)移最終洗脫的核酸等。

Fig 3 Agencourt SPRIselect 自動(dòng)化核酸回收、選擇操作系統(tǒng)

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