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速度！12分鐘Pooling 384個NGS文庫

貝克曼庫爾特生命科學 2020-09-15 | 閱讀：4100

Pooling是測序文庫上機前的臨門一腳。經過數小時乃至幾天的實驗，初始樣品終于變成濃度、片段大小都符合質控指標的library嗷嗷待測。Pooling實驗通常由兩位操作者協(xié)作。根據表單信息將文庫歸一化到一定濃度，再將想要合并測序的文庫混合，耗時耗力。

事實上Pooling完全可以不需要密集的吸液移液操作，不需要這么多時間和精力投入，甚至就不需要移液器和吸頭。采用Echo聲波移液系統(tǒng)，12分鐘即可完成384個文庫pooling¹，而手工完成歸一化和pooling需耗時長達3小時。

Echo通過聚焦聲波能量轉移低至2.5nL的樣品，不需要吸頭，無物理接觸。每秒傳輸幾百個液滴實現(xiàn)nL到uL級的液體傳輸。Echo可以微量化反應體系到幾微升，甚至數百納升，將樣品從微孔板任意孔快速轉移到目的板任意孔。在基因組學及合成生物學中，被應用到微量化NGS建庫和快速pooling文庫、引物、寡聚核苷酸探針當中。

Echo 一步法NGS文庫Pooling

Echo不與文庫樣本直接接觸，不需要費時間加載或清洗吸頭，可以在不到一秒的時間將微孔板上的NGS文庫轉移到目標孔內。

高濃度文庫不需額外稀釋。通過nL至uL級液滴轉移，將濃度歸一化和pooling簡化為一步進行。

數據管理和自動化操作可以避免人工操作失誤，提高實驗過程的可靠性。

Echo可關聯(lián)輸入文件，軟件自動完成高通量pooling

左：將需要pooling的各文庫信息寫入輸入文件，采用Echo一步法完成Pooling。
右：比較384個文庫的200 nL/文庫等體積Echo混樣和等摩爾量Echo混樣。
結果顯示經Echo pooling后文庫獲得更加均一的測序量。

Echo 微量化NGS文庫定量質控

Echo可完成384孔甚至1536孔每板的超高通量微量化文庫質控定量。聲波移液含DNA染料的緩沖溶液、文庫到酶標板中進行熒光檢測?；蚴沁M行文庫qPCR檢測體系構建，避免標準品梯度稀釋的累積誤差和氣溶膠污染。文庫定量的微量化能夠減少試劑消耗，有效控制成本。此外，Echo支持在軟件中以表單的形式挑選某些文庫做qPCR。整個實驗過程數據可循，避免手工操作的竄孔等錯誤。