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為什么要分離病毒及構(gòu)建假病毒?文末有干貨!

為什么要分離病毒及構(gòu)建假病毒?文末有干貨!
貝克曼庫爾特生命科學(xué)  2020-05-26  |  閱讀:9306

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新冠疫情已經(jīng)在全球范圍爆發(fā),目前確診感染人數(shù)已經(jīng)超過190萬,并且這一數(shù)值還在持續(xù)增長中。在疫情爆發(fā)初期,我國科研戰(zhàn)線迅速行動(dòng),不到一周時(shí)間就確定了新冠病毒的全基因組序列并分離得到了病毒毒株,及時(shí)向全球共享。那么為什么分離病毒毒株這么重要呢?

毒株分離的意義和難度

病毒毒株的分離對于疫情的防控、抗病毒藥物的篩選、疫苗研制等都具有重要意義。首先,分離病毒毒株后,可以得到新冠病毒包括衣殼蛋白、全基因組序列在內(nèi)的更詳細(xì)的信息,幫助快速診斷試劑盒的研發(fā),這對于新冠肺炎患者的臨床診斷和治療有非常積極的幫助。其次,得到病毒毒株后,將助力于其致病機(jī)理的研究,例如新冠病毒與宿主的結(jié)合機(jī)制、感染病毒后細(xì)胞內(nèi)的免疫應(yīng)答等等。最后,病毒毒株的成功分離可以幫助進(jìn)行抗病毒藥物的篩選和疫苗的研發(fā)。正如中國工程院李蘭娟院士所說,“分離出病毒毒株,意味著我們已經(jīng)擁有了疫苗的種子株。用其制作疫苗株并通過檢測后,就可以制備疫苗”。

左圖1:新冠病毒電鏡照片(來自中國微生物組數(shù)據(jù)中心);右圖2:新冠病毒透射顯微鏡圖像(來自NIAID-RML)

然而,雖然目前全國各地新冠研究、藥物及疫苗研發(fā)如火如荼地開展,但由于新冠病毒株的高傳染性與高危險(xiǎn)性,毒株始終較難獲得,早期研發(fā)不易推進(jìn)。究其原因,首先是培養(yǎng)新冠病毒對實(shí)驗(yàn)室要求極高 — 至少須生物安全水平三級(jí) (BSL-3) 實(shí)驗(yàn)室;其次實(shí)驗(yàn)人員資質(zhì)、工作流程、污染物的處理都須通過嚴(yán)格的審核,并得到國家衛(wèi)健委批準(zhǔn)。

假病毒及病毒載體揭秘

隨著科學(xué)家們不斷深入地了解和研究,開發(fā)表達(dá)刺突蛋白(S蛋白)的新冠假病毒成為輔助治療性篩選的有力工具。截止到目前為止已有多篇基于SARS-CoV-2假病毒中和抗體活性檢測的文章發(fā)表在國際權(quán)威雜志上。假病毒不僅可應(yīng)用于血清中和抗體檢測,還為后續(xù)單克隆抗體及抗病毒藥物篩選和評價(jià)、疫苗研發(fā)及病毒感染機(jī)制研究等奠定了基礎(chǔ)。

圖3:由中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院/北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院病原生物學(xué)研究所的研究團(tuán)隊(duì)在國際頂級(jí)學(xué)術(shù)期刊Nature的子刊Nature Communication上發(fā)表 ——《Characterization of spike glycoprotein of SARS-CoV-2 on virus entryand its immune cross-reactivity with SARS-CoV》。此項(xiàng)研究構(gòu)建SARS-CoV-2 S蛋白假病毒系統(tǒng)和293T的hACE2穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞系,以此確定SARS-CoV-2的易感細(xì)胞系、病毒受體、侵入途徑和蛋白酶激活,揭示了SARS-CoV-2入侵人體細(xì)胞的具體過程。

圖4:SARS-CoV-2-S假病毒包裝過程,圖片來源醫(yī)麥新觀察丨《新冠病毒株極難獲得,假病毒提供解決方案助力藥物開發(fā)》

假病毒是依據(jù)已公開的序列而制備成一種具有原病毒的基本特點(diǎn)和免疫原性,同時(shí)又不具備致病性,方便實(shí)驗(yàn)室大規(guī)模使用的替代物。由于其生物安全風(fēng)險(xiǎn)較低(僅要求實(shí)驗(yàn)室生物安全級(jí)別二級(jí)(BSL-2)),質(zhì)控方法可控,可以長期穩(wěn)定制備和供應(yīng)。假病毒因其具有“逼真” 、穩(wěn)定、安全等特點(diǎn),已被廣泛用于研究感染機(jī)制,受體識(shí)別和病毒抑制,以及開發(fā)和評估抗體和疫苗。

假病毒構(gòu)建通常都依賴于病毒載體系統(tǒng)的重組包裝(圖5),理想的病毒載體同樣也表現(xiàn)出基因組穩(wěn)定性、細(xì)胞型特異性、有效感染率高、對受感染細(xì)胞生理機(jī)能影響小,同時(shí)致病性小等特點(diǎn)。借助病毒載體,例如,慢病毒 (Lentivirus)、水泡性口炎病毒(Vesicular Stomatitis Virus, VSV)、腺病毒 (Adenovirus)、腺相關(guān)病毒(Adeno-associated Virus, AAV)將外源基因轉(zhuǎn)導(dǎo)入細(xì)胞并構(gòu)建新的假病毒模型已被廣泛應(yīng)用于生命科學(xué)研究,科學(xué)家已經(jīng)探索了出多種用于創(chuàng)建包膜型假病毒的包裝系統(tǒng),用于諸如埃博拉病毒(EBOV),馬爾堡病毒(MARV)和拉沙熱病毒(LASV)等新興傳染病(EID)的研究。

科研人員使用假病毒模擬抗體阻斷病毒進(jìn)入細(xì)胞的生物過程,檢測抗體或血清對假病毒是否具有中和活性 (假病毒通常經(jīng)過改造以攜帶熒光素酶報(bào)告基因,使其進(jìn)行定量分析時(shí)比對野生型病毒容易得多,而且已證明假病毒感染的細(xì)胞數(shù)量與報(bào)告基因表達(dá)成正比)。圖5:假病毒包裝過程 - 將熒光素酶和gp64基因插入VSV的全長cDNA克隆中(代替G基因命名為ΔG-Luc)。gp64pv和VSVpv是通過將VSVΔG / Luc-* G分別瞬時(shí)感染表達(dá)GP64和VSVG的293T細(xì)胞而產(chǎn)生的。

由于病毒與假病毒顆粒較小,直徑基本在20-300納米之間 (新冠病毒電鏡照片顯示其直徑僅為100納米),低轉(zhuǎn)速、低離心力條件并不能使病毒顆粒充分沉降,須借助超速離心技術(shù)來進(jìn)行病毒顆粒分離。

而病毒載體的分離方式與病毒類似—當(dāng)攜帶目的基因的病毒載體感染培養(yǎng)的細(xì)胞,受感染細(xì)胞生產(chǎn)新的同類病毒,并釋放進(jìn)入培養(yǎng)基中,再將新病毒重新采集并純化。在此過程中產(chǎn)生的病毒載量、純度和質(zhì)量都會(huì)直接影響后續(xù)載體的轉(zhuǎn)導(dǎo)效率。高效可靠的離心方案同樣有助于優(yōu)化病毒載體純化,例如:在高速和超速離心條件下,能有效地將病毒顆粒從細(xì)胞、細(xì)胞碎片中精細(xì)分離;借助分析性超速離心(AUC) 的流體動(dòng)力學(xué)和熱力學(xué)全方位精準(zhǔn)測量,則可根據(jù)病毒衣殼密度(一種病毒載量衡量方式),來真實(shí)鑒定區(qū)分完整、含部分遺傳物質(zhì)、空殼病毒載體及其他細(xì)胞雜質(zhì),提高包裝效率,提供藥用級(jí)別病毒載體顆粒質(zhì)控 。

您可以通過以下視頻了解病毒純化流程

想了解詳細(xì)的病毒和假病毒分離方法及步驟,請關(guān)注下期內(nèi)容《如何高效分離新冠病毒毒株與假病毒》,小貝將具體解析超離純化病毒的實(shí)驗(yàn)方法,敬請期待!

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自1947年第一臺(tái)商用超速離心機(jī)發(fā)明以來,貝克曼庫爾特離心技術(shù)已有70多年的發(fā)展歷史。早在19世紀(jì)60年代,已有科學(xué)家使用貝克曼離心機(jī)成功分離了多種病毒顆粒。到今天,貝克曼超速離心技術(shù)已助力科學(xué)家們分離得到冠狀病毒、流感病毒、肝炎病毒、腺病毒、慢病毒等幾乎所有類型的病毒種類。

貝克曼龐大的用戶群體已發(fā)表了數(shù)以萬計(jì)的病毒分離方法,為研究人員儲(chǔ)存了大量文獻(xiàn)支持,在助力病毒研究的同時(shí),也使貝克曼離心機(jī)成為了當(dāng)之無愧的病毒分離專家!

參考文獻(xiàn)

1. Xiuyuan Ou et al. Characterization of spike glycoprotein of SARS-CoV-2 on virus entry and its immune cross-reactivity with SARS-CoV. Nat Commun. 2020 Mar 27;11(1):1620. 

2. Yuuki Kaname et al. Acquisition of Complement Resistance through Incorporation of CD55/Decay-Accelerating Factor into Viral Particles Bearing Baculovirus GP64. JOURNAL OF VIROLOGY, Apr. 2010, p. 3210–3219 Vol. 84, No. 7

3. Qianqian Li et al. Current status on the development of pseudoviruses for enveloped viruses. Reviews in Medical Virology : Vol 28 , No 1


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